Университетам стран ЕАЭС, которые планируют подготовить совместный инновационный проект, стоит начать с исследовательской задачи и поиска партнёров. Условия финансирования определяет конкретный конкурс, а документы Евразийской экономической комиссии задают направления научного сотрудничества.
Савина и Парфенова в исследовании 2023 года связывают перспективы научной кооперации в ЕАЭС с подготовкой специалистов, развитием инфраструктуры и технологическими проектами. Для университета это повод сформулировать задачу, над которой научные коллективы разных стран будут работать вместе. Затем партнёрам нужно согласовать роли и ожидаемый результат совместной разработки.
Евразийская экономическая комиссия публикует нормативную базу научно-технического сотрудничества. В рекомендациях 2022 года её коллегия обозначила приоритеты и долгосрочный прогноз научно-технического развития Союза, а также предложила методы технологического прогнозирования. Эти документы помогают соотнести замысел проекта с направлениями сотрудничества.
Чтобы подготовить проект, университету нужно согласовать задачу с партнёрами и выбрать конкурс, под условия которого будет составлена заявка на финансирование. Нормативная база комиссии сама по себе не открывает приём заявок на грант.