По информации МГТУ ГА, государственную стипендию назначают аспирантам, которые учатся очно за счёт бюджетных ассигнований федерального бюджета. На первом году обучения её выплачивают всем аспирантам с начала учебного года по месяц окончания первой промежуточной аттестации. В дальнейшем стипендию назначают по результатам промежуточной аттестации, начиная с первого числа месяца, следующего за месяцем её окончания. Для этого у аспиранта не должно быть ни оценок «удовлетворительно» по итогам аттестации, ни академической задолженности.
Когда аспиранту предоставляют академический отпуск, отпуск по беременности и родам или отпуск по уходу за ребёнком до достижения им возраста трёх лет, выплату государственной стипендии приостанавливают с первого числа месяца, следующего за месяцем предоставления отпуска. После этих отпусков стипендию вновь выплачивают с первого числа месяца выхода. При этом учитывают результаты аттестации, которые были у аспиранта на дату предоставления отпуска, и период обучения, за который он уже получил стипендию.
Образовательная организация устанавливает размер государственной стипендии аспирантам и решает, как распределять средства стипендиального фонда. Согласно порядку, утверждённому Минобрнауки России, размеры выплат определяют в пределах средств стипендиального фонда. Определяя размеры выплат и порядок распределения фонда, организация учитывает мнение совета обучающихся, а также выборного органа первичной профсоюзной организации, если такой орган действует.